Malgré les difficultés engendrées par l'épidémie de Covid-19, le Groupement de défense sanitaire Alsace a su mener à bien les missions qui lui sont dévolues en 2020 : la surveillance des troupeaux et le dépistage des maladies. Si la BVD recule, l'IBR plafonne, tandis que la besnoitiose frappe timidement aux portes des élevages alsaciens. Et, en ligne de mire, la loi de santé animale (LSA) entend renforcer la prévention des maladies à l'échelle européenne.

Le Groupement de défense sanitaire (GDS) Alsace est parvenu à surmonter les difficultés liées à la crise sanitaire. Comme le souligne son nouveau président, Frédéric Bernhard, qui a succédé à Patrick Bastian en octobre dernier, les salariés de la structure ont su s'adapter tant bien que mal à cette situation inédite. « Grâce au télétravail, nous avons pu assurer le suivi des dossiers. Sur le terrain, la tâche était un peu plus compliquée qu'à l'accoutumée. » « Les prophylaxies ont eu énormément de mal à être terminées cette année, entre les vétérinaires qui limitaient leurs activités, et les éleveurs qui ne voulaient accueillir personne sur leurs exploitations », complète la directrice du GDS Alsace, Céline Zuber. La fin de la prophylaxie 2020 a donc dû être décalée au 1er octobre. Un report exceptionnel qui a engendré une surcharge de travail importante pour le GDS Alsace. IBR : objectif « indemne » d'ici 2027 Cette campagne de prophylaxie prolongée a livré des signaux encourageants sur l'état sanitaire des troupeaux en Alsace. Concernant la rhinotrachéite infectieuse bovine (IBR), on est à 93 % de cheptels indemnes à l'heure actuelle. « Un chiffre qu'on n'arrive presque pas à faire progresser aujourd'hui, fait remarquer Céline Zuber. On a 4 % de cheptels en cours de qualification, et ça a du mal à bouger. Il manque toujours quelque chose pour qualifier de nouveaux troupeaux. » Malgré tout le travail de surveillance opéré depuis des années, le GDS Alsace fait état de nouveaux cheptels contaminés par l'IBR lors de la campagne 2019-2020. Problème : l'origine de la contamination reste incertaine. « Et si on ne sait pas comment ces troupeaux ont été contaminés, c'est plus compliqué de mettre en œuvre des actions de prévention et de surveillance », poursuit-elle. C'est d'autant plus embêtant que se profile l'entrée en vigueur de la loi de santé animale (LSA) (lire encadré). Dès le 21 avril prochain, chaque GDS devra appliquer un programme de surveillance européen pour obtenir une qualification de pays « indemne » d’IBR. Il faut arriver à un minimum de 99,8 % de cheptels sains, contre 91,5 % aujourd'hui. Un objectif qui devrait être atteint d'ici 2027. La reconnaissance de pays « indemne » permettra à la France d’exporter ses animaux sans contraintes. « L'idée est d'être au même niveau sanitaire que les autres pays européens et maintenir nos capacités commerciales », précise Céline Zuber. Des évolutions à prévoir avec la LSA Cette LSA aura des répercussions « importantes » pour le GDS Alsace et les exploitations, prévient Frédéric Bernhard. « Des solutions techniques sont étudiées à tous les niveaux pour limiter les surcoûts engendrés. Le dépistage des principales maladies et la vaccination FCO pour l'export n'en sont que quelques exemples. » Pour l'IBR, les modalités de contrôle des troupeaux vont aussi évoluer en fonction de l'ancienneté de la qualification du cheptel et du type de troupeau. Pour les cheptels qualifiés depuis moins de quatre ans, et ceux de moins de 100 vaches laitières, rien ne change par rapport à aujourd'hui. Par contre, pour les cheptels allaitants qualifiés depuis plus de quatre ans, les contrôles seront allégés et seuls 30 % des bovins de plus de 24 mois seront prélevés. Les plus gros changements induits par la LSA vont concerner les cheptels non qualifiés : pour eux, analyses individuelles obligatoires de tous les bovins, ce qui sous-entend la contention des jeunes animaux. Des interrogations demeurent sur les cheptels laitiers de plus 100 vaches. « À ce jour, il faudrait appliquer le même protocole que les cheptels allaitants. Des discussions sont en cours pour savoir si nous pourrions travailler à partir d'échantillons du contrôle laitier. Ce qui implique que les laboratoires soient capables de faire des mélanges », explique Céline Zuber. La BVD perd du terrain En matière de prophylaxie, la diarrhée virale bovine (BVD) reste la plus grosse action menée par le GDS Alsace tout au long de l'année. Lors de la campagne 2019-2020, les résultats de dépistage ont été globalement très bons. Moins de 0,1 % de veaux positifs à la BVD ont été enregistrés lors des trois derniers trimestres de 2020. « La situation commence à devenir très favorable, même si elle reste assez hétérogène sur le terrain. Il y a des zones où tous les résultats sont négatifs, d'autres zones qui concentrent la majorité des résultats positifs », commente Céline Zuber. Et pour la première fois également, aucun cheptel avec un premier résultat positif n'a été enregistré au dernier trimestre de 2020. « Le programme de bouclage des veaux lancé en 2017 semble porter ses fruits. Mais pour qu'il réussisse, il faut que des mesures efficaces et rapides soient prises : élimination des animaux positifs, dépistage des derniers bovins qui n'ont pas de statut, et mise en place de la vaccination. » Ces bons résultats ont poussé le GDS Alsace à proposer, lors de la campagne 2019-2020, des dépistages sérologiques dans cent exploitations situées dans des zones « favorables », dans lesquelles il n'y a pas de circulation virale depuis au moins deux ans. Les premiers chiffres sont encourageants : 37 % des cheptels sont négatifs et peuvent donc arrêter les boucles ; 31 % des boucles peuvent arrêter les boucles moyennant des analyses complémentaires ; 18 % des cheptels restent à ce jour non analysés ; et seulement 14 % des cheptels doivent pour l'instant conserver les boucles. « Certes, la sérologie est intéressante. Néanmoins, elle nécessite tout de même plus d'expertise technique entre nos équipes et les vétérinaires pour analyser certaines situations dans lesquelles il y a des résultats positifs sans que cela soit le signe de la circulation de la maladie », observe la directrice du GDS Alsace. Le dépistage sérologique de la BVD va prendre de l'ampleur dans les prochains mois, et va être déployé auprès des cheptels à faible risque de contamination. De grosses « disparités » pour la paratuberculose Le GDS Alsace s'occupe aussi de la surveillance de la paratuberculose. Dans les cheptels engagés en plan de lutte, des dépistages annuels de tous les animaux de plus 24 mois sont réalisés. Lors de la dernière campagne, ce sont 46 cheptels qui ont été passés à la loupe, soit 4 660 animaux. Au final, le taux de positivité ne s'élève qu'à 2,4 %. Un chiffre faible au premier abord qui cache toutefois de grosses disparités entre les élevages. Sur les 46 cheptels, 6 n'ont pas le moindre bovin positif à la paratuberculose ; 23 ont moins de 5 % de bovins positifs ; et 17 ont plus de 5 % de bovins positifs. « Dans ces cas les plus critiques, l’assainissement va être long car derrière on sait qu'il y a une capacité d'élimination des cheptels qui n'est pas toujours là, et il y a toujours des réformes à faire pour la paratuberculose. La meilleure façon de se prémunir face à cette maladie, c'est simplement d’éviter de s’infecter en introduisant des animaux non infectés », poursuit Céline Zuber. La besnoitiose frappe à la porte Reste enfin le cas de la besnoitiose, une maladie « émergente » en Alsace, bien connue dans le sud du pays. En l’absence de statut de cheptel, le GDS Alsace teste systématiquement les animaux de plus de trois mois non issus du Grand Est, de la Franche-Comté et des Hauts-de-France. Un bovin aubrac introduit dans un cheptel alsacien à l'automne 2019 a été diagnostiqué positif à cette maladie. « Après enquête, il s'est avéré que le risque d'introduction remonte à 2017, date à laquelle cet élevage a commencé à introduire des bovins du même troupeau d'origine », note Céline Zuber. Suite à ce diagnostic, le GDS a identifié tous les voisins de parc, les cheptels des communes alentour, et les acheteurs. Bilan : deux troupeaux infectés en Alsace. « Et malheureusement, l'assainissement est quasi impossible car on a plusieurs animaux positifs. C'est compliqué, car cette maladie ne se soigne pas. » Pour éviter que la situation n'empire, le GDS Alsace va maintenir une vigilance accrue au cours des prochains mois. Au programme : identification des voisins de parc, dépistage des animaux des voisins de parc, et suivi des bovins qui sortent des cheptels infectés pour s'assurer qu'ils partent bien en atelier d'engraissement ou à l'abattoir.